2020年6月1日，中共中央、國務院發布了《海南自由貿易港建設總方案》，該方案在貿易自由便利方面采取了“一線”放開、“二線”管住的進出口管理政策制度設計，其中加工增值免關稅政策是重要容之一。據該方案，海南自由貿易港鼓勵類產業企業生產的不含進口料件或者含進口料件在海南自由貿易港加工增值超過30%（含）的貨，經“二線”進地免征進口關稅，但需要照章征收進口環節增值稅、消費稅。這是中央賦予海南自由貿易港的一項重要政策，也是海南自由貿易港封關運作前先行先試的核心政策之一。
目前，這項政策已經開始實施，海關已經免征關稅3.8億元。據海口海關副關長田濤的介紹，自2021年7月起，加工增值稅收政策首單業務在洋浦保稅港區落地，2021年12月擴大到海口綜合保稅區和海口空港綜合保稅區等省其他海關特殊監管區域試點，2022年11月進一步擴大至海關特殊監管區域外符合條件的海南自由貿易港重點園區企業試點。截至2023年10月，海關監管加工增值銷貨值達到45.2億元，免征關稅金額為3.8億元。全省共有21家企業開展加工增值銷業務，其中海關特殊監管區域企業16家，海關特殊監管區域外企業5家，涵蓋了食品加工、醫藥醫械、生制品、首飾加工等產業。
加工增值稅收政策的試點實施對推進自貿港建設有積極意義。首先，它有利于構建中國特自由貿易港政策制度系，是該系的重要組部分。其次，它有利于為封關運作積累經驗，通過開展力測試，推在政策實施、監管模式、件配套、風險防控等方面的測試，為封關運作打下基礎。最后，它有利于促進海南省產業發展，特別是高端加工制造業的發展，同時也可以輻帶國市場，打造國國際雙循環的重要匯點。
為了保障加工增值稅收政策的順利實施，海口海關采取了一系列創新監管服務措施。他們制定了配套的監管辦法，開展政策宣講，加大企業培育力度，配合做好企業篩選及審核，并完了系統升級改造，創新實施企業ERP數據與海關聯網對接。同時，他們還簡化了業務辦理流程，優化了EPR聯網對接方式，提升了力測試能力，做好了風險防控工作。
未來，海口海關將繼續按照海關總署的工作部署，加大對企業的服務力度，持續跟蹤政策實施態，推進出口政策制度試點容與范圍的擴大，全面提升力測試的廣度、深度、力度。他們還將繼續努力讓企業更多的政策紅利，提供更便利的通關驗，營造更優質的營商環境，為海南自貿港的高水平開放和高質量發展提供支持。